L'allergia è una reazione eccessiva dell'organismo nei confronti di una sostanza estranea (allergene). Il sistema immunitario reagisce cioè in maniera anomala, poichè presenta un'anormale iperattività (è cioè più sensibilizzato) verso sostanze normalmente innocue, e si innescano una serie di reazioni che portano al fenomeno allergico.
L'allergia si scatena dopo che l'organismo si è sensibilizzato all'allergene: in seguito ad un primo contatto con la sostanza estranea, il sistema immunitario si programma per reagire in maniera esagerata ad un eventuale ulteriore contatto. Quando l'allergene entra nell'organismo, viene fagocitato dai macrofagi, cellule di difesa primarie. Alcune parti dell'allergene si possono disporre all'esterno della membrana cellulare dei macrofagi, dove possono essere riconosciute da altre cellule del sistema immunitario. Questa interazione determina la produzione di immunoglobuline E, che si legano a loro volta ad altre cellule (mastociti), dove permangono in maniera stabile.
Quando un organismo sensibilizzato entra nuovamente in contatto con l'allergene, questo viene direttamente riconosciuto dalle immunoglobuline E, presenti sulla superficie dei mastociti, e si scatena una serie di reazioni che provocano la distruzione del mastocita stesso e la liberazione di mediatori preformati (istamina), responsabili del pririto, degli starnuti, della rinite, della broncocostrizione, e mediatori neoformati (leucotrieni, prostaglandine, PAF, fattori chemiotattici), che aggravano e prolungano i sintomi della reazione allergica, nonostante non si sia più esposti direttamente all'azione dell'antigene.
Esistono numerosi metodi di approccio naturale a questo problema: combattere gli allergeni, che sono numerosissimi, è un tentativo inutile di debellare l'allergia, mentre è più utile agire sull'organismo dell'individuo affetto da questo problema.